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오늘은 해피캠퍼스에서 발췌한 “plasmid DNA prep 및 genomic DNA prep” 내용을 정리하여 알려드립니다.
목차
1. Subject
2. Date
3. Purpose
4. Introduction
5. Material & Method
6. Result
7. Discussion
8. Reference
본문내용일부
1. Subject
plasmid DNA prep 및 genomic DNA prep
2. Date
3. Purpose
plasmid DNA prep와 genomic DNA prep의 원리를 이해하고 실험을 수행할 수 있다.
4. Introduction
1. plasmid DNA / genomic DNA란?
그림 1. Plasmid DNA / Genomic DNA
1) Plasmid DNA
① 정의 및 특징
1952년 미국의 유전학자 J. 레더버그가 최초로 플라스미드를 세균의 염색체 이외의 독자적으로 증식할 수 있는 DNA 분자라는 의미로 명명. 플라스미드(plasmid)는 생장에 필수적인 염색체(chromosom) DNA에서 물리적으로 분리되어 있는 대표적인 에피솜(episome) DNA 분자.
플라스미드는 대개 박테리아의 내부에서 박테리아 염색체와 독립적으로 존재. 그러나 일부 플라스미드는 박테리아 염색체에 삽입되는 경우가 있으며, 이처럼 박테리아 염색체에 삽입할 수 있는 능력을 가진 플라스미드를 "에피솜(episome)"이라 정의. 박테리아 염색체에 삽입된 에피솜은 독립적으로 복제할 수 없어 박테리아 DNA가 복제할 때 에피솜도 같이 복제. 때에 따라 삽입된 에피솜은 박테리아 염색체에서 빠져나와 다시 독립된 플라스미드로 존재할 수 있음.
박테리아 염색체는 평균 수 백만 kb인 반면, 플라스미드는 대개 1 kb에서 200 kb 이내이며, 대부분 환형이지만 선형 플라스미드도 관찰 됨. 세포에서 분리한 플라스미드는 가장 압축된 상태인 초나선형(supercoil)으로 존재. 플라스미드는 자신의 복제기점을 소유하여 염색체와는 독립적으로 복제되어 증식 가능. 하지만 복제과정에 필요한 효소들은 숙주 염색체에 의존. 플라스미드가 세포내에 존재하는 숫자가 다른데, 이것을 복제수 (copy number)라 함. 이러한 복제수는 플라스미드 상에 있는 유전자와 숙주와 플라스미드 사이의 상호작용에 의해 결정. 일부 진핵생물에서도 존재하지만 주로 세균에서 많이 발견되며 바이러스와는 달리 세포내에서만 존재.
참고문헌
plasmid DNA / genomic DNA란?
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“Isopropyl alcohol”, wikipedia, 2020.10., https://en.wikipedia.org/wiki/Isopropyl_alcohol
“Phenol chloroform”, wikipedia, 2020.10.09., https://en.wikipedia.org/wiki/Phenol%E2%80%93chloroform_extraction
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